מאז הקמתו מוביל המכון תהליכים של הטמעת חדשנות חינוכית פדגוגית וטכנולוגית מדעית. המכון פועל יחד עם בתי הספר ולמענם ליצירת בתי ספר ייחודיים, חדשניים ויצירתיים באמצעות: ניהול ובקרה של תכניות החדשנות הבית ספריות, עידוד יזמויות ושותפויות וטיפוח קהילות מקצועיות לומדות. יחידת ההשתלמויות אורט אפיקים שהחלה דרכה במכון, מכשירה כיום מידי שנה כ-5000 מורים ומנהלים במגוון הכשרות והשתלמויות.